Transparência de Dados Aprimorada com a mais Recente Ferramenta de Laboratório Digital

O aprendizado de máquina fez um progresso significativo, prometendo acelerar e aprimorar o processo de pesquisa de novos medicamentos. Além disso, a adoção do formato automatizado de troca de dados chamado ‘EnzymeML’ contribui para aumentar a transparência em experimentos enzimáticos.

As ciências catalíticas estão enfrentando um aumento tanto na quantidade quanto na complexidade dos dados de pesquisa, o que dificulta a análise e a obtenção de conclusões significativas. Esse dispositivo serve como um formato de troca de dados e oferece o potencial de simplificar esses processos e aborda os desafios apresentados pelos dados.

EnzymeML

O EnzymeML vem da Universidade de Stuttgart e serve como um formato digital para documentar os resultados de um experimento enzimático. Ele facilita o armazenamento de dados de forma estruturada, garantindo a rastreabilidade e promovendo a reutilização dos dados.

Muitas instituições de pesquisa consideram o gerenciamento manual de dados um processo demorado e propenso a erros. Além disso, o acesso e a reanálise de dados de outros grupos de pesquisa se tornaram extremamente desafiadores.

Complexidade dos Dados

Além da complexidade dos dados, a ausência de padrões, os metadados incompletos e a falta de dados originais contribuem ainda mais para a falta de transparência. Consequentemente, isso cria desafios para os centros de pesquisa que tentam replicar os resultados publicados por outros.

Os cientistas que estudam a atividade catalítica, a seletividade e a estabilidade de enzimas e redes enzimáticas enfrentam essas dificuldades. Esses pesquisadores trabalham em áreas como a biotecnologia industrial e a biomedicina.

Nessas áreas, os dados relacionados a experimentos enzimáticos são notavelmente complexos devido a vários fatores que influenciam as reações enzimáticas. Esses fatores incluem a sequência da proteína da enzima, o organismo hospedeiro usado para a expressão recombinante, as condições da reação e as reações secundárias não enzimáticas.

Inativação ou Inibição da Enzima

Além da complexidade, há situações em que fatores externos podem levar à inativação ou inibição da enzima, e os resultados também podem ser afetados pela evaporação do meio.

Para enfrentar esses obstáculos, o EnzymeML oferece uma solução abrangente, documentando totalmente os resultados de um experimento enzimático. Ele abrange tudo, desde as condições de reação e os dados medidos até o modelo cinético utilizado para a análise de dados e os parâmetros cinéticos estimados.

A Era digital

A tecnologia digital promove o estabelecimento de uma via de comunicação que conecta plataformas experimentais, cadernos de laboratório eletrônicos, ferramentas de modelagem de cinética enzimática, plataformas de publicação e bancos de dados de reações enzimáticas.

Devido à natureza estruturada e padronizada dos documentos EnzymeML, os resultados experimentais que eles contêm podem ser facilmente trocados e reutilizados por outros grupos de pesquisa. Outra vantagem é que os dados no formato EnzymeML são legíveis por máquina, permitindo sua utilização em fluxos de trabalho automatizados para armazenamento, visualização, análise e reanálise de dados atuais e publicados anteriormente. Não há limitações quanto ao tamanho de cada conjunto de dados ou ao número de experimentos que podem ser manipulados.

Leia o Artigo Original: DigitalJournal.

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